DNA-testien lisääntyminen palveluiden, kuten 23andme, kautta osoittaa, että siellä on suuria markkinoita perhehistorialle.
Nyt tutkijat ovat perustaneet kyseiset tiedot julkaisemalla, mitä heidän mielestään on maailman suurin sukututkimustietokanta, sukupuulla, joka yhdistää 13 miljoonaa ihmistä ja ulottuu yli viiteen vuosisataan.
Kuten Jocelyn Kaiser raportoi Science- lehdelle, Columbian yliopiston laskennallinen geneetikko Yaniv Erlich harkitsi hanketta seitsemän vuotta sitten saatuaan sähköpostin etäiseltä sukulaiselta serkkulta Geni.comin kautta, joka on yksi monista sivustoista, joissa etsitään perhesuhteita.
Gemi.com: n teknisen päällikön tuella Erlich latasi sivuston julkiset profiilit - niistä kymmeniä miljoonia. Vaikka tiedot eivät tarjoa DNA-tietoja, tietoihin sisältyi henkilön nimi, sukupuoli, syntymäaika ja -paikka, kuolemapäivä ja välittömät sukulaiset.
Luonto kirjoitti Erlichin projektista sen alkuvaiheessa jo vuonna 2013, ja viime vuonna Atlantin Sarah Zhang kertoi tutkijoiden julkaissut esipainan massiivisesta puusta. Kaiser kirjoittaa, että Erlichin joukkue on julkaissut tutkimuksen heidän työstään Science-lehdessä. Tietoja käyttämällä he saivat 5, 3 miljoonaa puuta, joista suurin yhdistää noin 13 miljoonaa sukulaista, lähinnä eurooppalaista alkuperää.
Projektin aloittamisesta lähtien Erlichistä on tullut Geni.com: n omistavan suku- ja DNA-testausyrityksen MyHeritage-pääjohtaja. Hän teki viime perjantaina Redditin Kysy minulta jotain havainnoistaan, korjaten väärinkäsityksiä ja selittäen projektin taustalla olevan metodologian. Hän huomautti myös, että mielenkiintoisin osa kokemusta hänelle oli miettiminen siitä, kuinka kaikki saatavilla olevat tiedot käännetään jotain henkilökohtaista.
Haastattelussa National Geographicin Nicole Wetsmanin kanssa Erlich sanoo, että haastattelu näiden tietojen kanssa oli myös projektin haastavin osa. ”Genomisissa tietojoukkoissa on erityisiä työkaluja, tietorakenteita, menetelmiä, mutta meillä ei ole tätä varten mitään. Keksimme pyörän menemällämme ", hän sanoo.
Viime kädessä tutkijat käyttivät matemaattista kuvaajateoriaa tietojen järjestämiseen ja todentamiseen, raportoi Laura Geggel Live Science -elokuvalle. He myös vertasivat profiileja noin 80 000 Vermontin julkisesti saatavilla olevaan kuolintodistukseen 25 vuoden ajanjakson aikana varmistaakseen, että kyseessä ei ole vain Geni.comiin ladatut varakkaat profiilit.
Ryhmä päätti sitten mitä tietoja he halusivat etsiä tietokannan testaamiseksi, Wetsman kirjoittaa.
He alkoivat tarkastella malleja ja havaitsivat elinkaaren vaihtelut, mitä he olivat odottaneet. He näkivät esimerkiksi pienten nuorten miesten pudonneen sisällissodan ja I ja II maailmansodan aikana ja lapsuuden selviytymisen lisääntyneen 1900-luvulla. He pystyivät myös seuraamaan muuttoa, kuten Mayflowerin saapuminen vuonna 1620 nykyiseen Massachusettsiin, mitä seurasi syntyneiden määrän lisääntyminen tällä alueella.
Tutkijat havaitsivat myös, että pitkäikäisyys liittyy enemmän ympäristöön ja käyttäytymiseen kuin genetiikkaan; Itse asiassa tiedot paljastivat geenit ovat vain 16 prosenttia vastuussa eliniän. Bostonin yliopiston kansanterveyskoulun biostatistiikan professori Paola Sebastiani varoittaa kuitenkin tekemästä johtopäätöksiä näiden tietojen perusteella Wetsmanin haastattelussa. "Pitkäikäisyyden määritelmissä on paljon sekaannusta", hän sanoo.
Geneetikko Peter Visscher Queenslandin yliopistosta, Brisbane, Australia, kertoo Kaiserille, että tiedot, joita Erlichin tiimi noudatti, pystyvät tarjoamaan käsityksen sairauksien genetiikan roolista, jos tiedot yhdistetään terveystietoihin.
Tutkimusryhmä on jo alkanut yhdistää puun DNA.Land-tiedon kanssa, joka lähtee DNA-tietojen lähteeksi, mikä saattaa tarkoittaa, että pian voi tulla vielä suurempi puu. Tutkijat ennustavat, että jos tietokanta voi palata 65 sukupolvea, he pystyvät viimeistelemään puun.
