https://frosthead.com

Kunnianhimoinen projekti 1,5 miljoonan lajin genomien sekvensoimiseksi käynnistyy

Viime viikolla maailmanlaajuinen tutkijoiden konsortio käynnisti virallisesti Earth BioGenome -projektin. Kuten Kate Kelland Reutersin raportissa, tukijat kutsuvat laajaa aloitetta seuraavaksi "biologian kuukautena". Arvioidaan, että se maksaa 4, 7 miljardia dollaria, ja sen tavoitteena on järjestää 1, 5 miljoonan eukaryoottisten eli monimutkaisten lajien DNA Maan päällä. . Jos meillä on niin monien lajien DNA-kartta, tutkijat sanovat, että ne muuttavat uudelleen sen, mitä tiedämme biologiasta, ekologiasta ja biologisesta monimuotoisuudesta.

Lehdistötiedotteen mukaan hanke on käynnistymässä Wellcome Sanger -instituutin uudella ponnistella, nimeltään Darwin Life of Project -hanke, jonka tavoitteena on järjestää kaikki 66 000 eukaryoottista lajia, joita Isossa-Britanniassa löytyy seuraavan kymmenen vuoden aikana. Kaikkiaan 17 instituutiota ympäri maailmaa, mukaan lukien Smithsonian, ovat allekirjoittaneet hankkeen ja esittävät suunnitelmansa lähitulevaisuudessa.

Tällä hetkellä tutkijat ovat sekvensoineet vain noin 3 500 monimutkaisen eläinlajin genomit ja vain noin 100 on sekvensoitu ”referenssilaadulla”, jota käytetään syvälliseen tutkimukseen. Kymmenien tuhansien genomien lisääminen luetteloon ei ole mitään vallankumouksellista.

"Puhumme uusista lääkkeistä, uusista polttoaineista tulevaisuudelle", Sanger Trustin Julia Wilson kertoo Victoria Gillille BBC: llä. "Rajoitamme tällä hetkellä mielikuvituksemme - emme voi edes kuvitella, mitä tämä kertoisi meille."

Kunnianhimoinen idea tuli ensimmäisen kerran yhteen vuonna 2015 kokouksessa, jota vetosi Harry A. Lewin, Kalifornian yliopisto, Davisin arvostettu evoluution ja ekologian professori; Gene Robinson, Illinoisin Carl R. Woese -yliopiston genomibiologian instituutin johtaja; ja W. John Kress, tutkimuskasvitieteilijä ja kuraattori Smithsonianin kansallisessa luonnontieteellisessä museossa.

Tutkijoita inspiroi Human Genome Project. Vaikka ihmisgenomin historiallinen sekvensointi vuonna 2003 oli vaatinut yli kymmenen vuotta, ja se maksoi tuolloin noin 3 miljardia dollaria (mikä, jos otat huomioon inflaation, maksaisi arviolta 5 miljardia dollaria päivästä toiseen), massiivinen pyrkimys vähensi dramaattisesti sekvensointipalvelujen kustannukset. Se asettaa tämän massiivisen hankkeen mahdollisuuksien ulottuville.

Valmistuttuaan Earth BioGenome -projektin uskotaan tuottavan exabyytti dataa eli miljardi gigatavua, joka jaetaan verkossa ilmaiseksi.

On vaikea sanoa, mihin geenikartoitus johtaa. "Tietomme aukot ovat paljon suurempia kuin mitä tiedämme", Lewin kertoo BBC: lle. ”Joten emme edes täytä palapelin palasia; suurin osa palapelissä on tyhjä. ”

Mutta kuten Wellcom Trustin tiedejohtaja Jim Smith huomauttaa, sama tapahtui, kun tutkijat pääsivät ensimmäistä kertaa työskentelemään Human Genome Project -hankkeessa neljäsosaa sitten. "[W] e ei voinut kuvitella, kuinka tuolloin tuotettu DNA-sekvenssi muuttaisi tutkimuksen nykyään ihmisten terveyteen ja sairauksiin", Smith sanoo. "Aloittaminen tehtävään järjestää koko maapallon elämä ei ole eroa."

Kunnianhimoinen projekti 1,5 miljoonan lajin genomien sekvensoimiseksi käynnistyy