Kodin DNA-sarjoista on tullut suosittu tapa oppia lisää esi-isistä ja geneettisestä meikistä - ja kätevät testit eivät ole vain ihmisille. Koiranomistajat, jotka haluavat tutkia fluffy-ystäviensä sukuhistoriaa ja paljastaa mahdollisten sairauksien riskit, voivat valita useista palveluista, jotka seulotaan koiran DNA: ta.
Kuten Kitson Jazynka raportoi National Geographicille, yksi näistä palveluista, Embark Veterinary, Inc., analysoi äskettäin käyttäjätietoja pysyvän koiran mysteerin avaamiseksi: Kuinka Siperian huskyt saivat loistavat siniset silmänsä?
Lävistyskurkut ovat tämän kauniin koiran määrittelevä piirre. PLOS Genetics -julkaisussa julkaistun uuden tutkimuksen mukaan kasvattajat kertovat, että siniset silmät ovat yleinen ja hallitseva piirre Siperian huskyjen keskuudessa, mutta ne näyttävät olevan harvinaisia ja taantuvia muissa rotuissa, kuten Pembroke Welsh corgis, vanhat englantilaiset lammaskoirat ja rajakollit. Joissakin rotuissa, kuten australialaisissa paimenissa, siniset silmät on liitetty epämääräisiin turkkikuvioihin, jotka tunnetaan nimellä “merle” ja “piebald”, jotka johtuvat tietyistä geneettisistä mutaatioista. Mutta ei ollut selvää, miksi muut koirat - pääosin heidän joukossaan Siperian husky - puhaltavat usein sinisillä silmillä.
Embarkin tutkijat toivoivat murtautuakseen tähän geneettiseen haittaan, tutkivat yli 6000 pookin DNA: ta, joiden omistajat olivat ottaneet koiriensa syljenäytteet ja toimittaneet ne yritykselle testattavaksi. Omistajat osallistuivat myös verkkokyselyyn ja lähettivät valokuvia koiristaan. Tutkimuksen kirjoittajien mukaan heidän tutkimuksensa merkitsi ”ensimmäistä kuluttajagenomitutkimusta, joka on koskaan tehty muulla kuin ihmismallilla, ja tähän mennessä suurin koirien genomin laajuinen assosiaatiotutkimus”.
Laaja analyysi paljasti, että Siperian huskyjen siniset silmät näyttävät liittyvän kopiointiin, joka tunnetaan nimellä koiran kromosomi 18, joka sijaitsee lähellä ALX4-nimistä geeniä. Tällä geenillä on tärkeä rooli nisäkkäiden silmien kehityksessä, mikä saa tutkijat epäilemään, että kopiointi ”voi muuttaa ALX4: n ekspressiota, mikä voi johtaa silmien pigmentointiin liittyvien geenien tukahduttamiseen”, Embarkin Aaron Sams kertoo käänteisen Sarah Sloatille.
Geneettinen variaatio liitettiin myös sinisiin silmiin ei-merle-australialaisissa paimenissa. Vain yksi kopio mutatoidusta sekvenssistä riitti antamaan koirille joko kaksi siniset silmät tai yhden sinisen ja yhden ruskean silmän, ilmiö, joka tunnetaan nimellä “heterokromia”. Vaikuttaa kuitenkin siltä, että kromosomin 18 kopiointi ei ole ainoa tekijä, joka vaikuttaa sinisen silmän väri: Joillakin koirilla, joilla oli mutaatio, ei ollut sinisiä silmiä.
Tarvitaan lisää tutkimusta aiheesta, jotta ymmärretään geneettiset mekanismit työssään sinisilmäisten koirien kohdalla. Mutta tutkimus osoittaa, kuinka kotona tehdyt DNA-sarjat voivat olla erittäin arvokkaita tutkijoille, tarjoamalla heille runsaasti tutkittavissa olevia geeninäytteitä.
"Kun 6 000 ihmistä saa koiristaan DNA-näytteitä ja postittaa ne keskitettyyn sijaintiin ja täyttämällä sitten verkkosivulomakkeen, jossa kuvataan koiran kaikki piirteet - se on pelimuuttaja siihen, miten genetiikka tapahtuu 2000-luvulla", Kristopher Länsimaisen terveystieteiden yliopiston eläinlääketieteellisen korkeakoulun geneetikko Irizarry kertoo National Geographicin Jazynkalle.
Tällaisten valtavien tietolähteiden käytön edut menevät pidemmälle kuin näyttävien näkemysten löytäminen koiran seuralaisista. Tutkijat ovat myös ryhmittyneet kotona toimivien DNA-testiyritysten kanssa saadakseen lisätietoja ihmisen genetiikasta ja käyttäytymisestä.
