Mitä yhteistä afrikkalaisilla kynsillä varustetuilla sammakoilla, orangutaneilla ja vuohilla on? Geneetikot ovat katsoneet syvälle, syvälle geeniensä sisälle: Näiden lajien koko genomi on sekvensoitu.
Asiaan liittyvä sisältö
- Mikä todella on siinä tonnikalarullassa? DNA-testaus voi auttaa sinua selvittämään
- Mitä tarkoittaa olla laji? Genetiikka muuttaa vastausta
- Nämä ovat sukupuuttoon kuolleita eläimiä, joita voimme ja joiden meidän pitäisi elää
Olet ehkä kuullut mahdollisuudesta saada sekvensoimaan koko oma genomi. Muutama vuosi sitten ihmisen perimän sekvensoinnin hinta laski 1 000 dollariin. Se ei ole taskuvaihto, mutta se ei ole myöskään 2, 7 miljardia dollaria, joka maksaa ihmisen ensimmäisen genomin sekvensoinnista. Eläimillä se on kuitenkin monimutkaisempaa. Koska ketään muista kyseisistä lajeista ei ole koskaan sekvensoitu, on vaikeampaa koota genomi ilman viitteitä.
Pyöreämatoista C. elegansista tuli ensimmäinen eläin, jonka genomi sekvensoitiin vuonna 1998. Siitä lähtien parempi genomisekvensointitekniikka on antanut tutkijoille mahdollisuuden siirtyä huomattavasti monimutkaisempiin organismeihin ja sekvensoida paljon nopeammin ja tehokkaammin.
Mutta on edelleen epätodennäköistä, että tutkijat koskaan järjestävät jokaisen eläimen genomin. Heidän on valittava. Joten mistä aloittaa?
Mikään kriteeri, jolla tämä päätös tehdään, ei ole. Joskus se on tietoisuuden lisääminen lajeista ja niiden mahdollisesta hyödystä ihmiskunnalle: Se oli syy Singaporen kansallisen yliopiston tutkijoille, jotka hakivat rahoitusta temppelikuopan viperin genomin sekvensoimiseksi aiemmin tänä vuonna, kirjoittaa Samantha Boh Singapore Timesille . Vipera on "ainoa käärmelaji, jonka tiedetään tuottavan toksiinia nimeltä wagleriini", hän kirjoittaa - "hermo-lihaksen estäjä, jonka tutkijoiden mielestä voitaisiin kehittää lihasrelaksantilääkkeeksi".
Genomisekvensoinnin potentiaalisten lääketieteellisten etujen lisäksi käytännössä on tärkeä tehtävä maailman tieteelliselle ja historialliselle ymmärtämiselle. "Elävien lajien genomit ovat historiallisia jalanjälkiä adaptiivisista tapahtumista, jotka johtivat nykyiseen sijaintiin", kertoi konferenssissa genomisen monimuotoisuuden laboratorion päällikkö Stephen O'Brien.
Eläinten nykyisten genomien tutkiminen voi kertoa tutkijoille heidän menneisyydestään lajana - sekä ympäristöistä, joissa he ovat asuneet, ja muista lajeista, jotka ovat eläneet heidän kanssaan. Esimerkiksi kotieläinten genomit voivat auttaa selittämään ihmiskunnan menneisyyttä. Sekä ihmiset että eläimet, kuten lehmät ja siat, muuttuivat (ja muuttuvat edelleen), kun osa ihmiskunnasta asettui asumaan ja aloitti viljelyn. Sen tutkiminen, kuinka ne kehittyivät kotoistuessaan, auttaa geneetikoita ymmärtämään muinaisen ihmisen evoluution tekijöitä, ja se voi auttaa selittämään, milloin eläimet tarkalleen kotoisivat.
Näiden kotieläinten genomilla on paljon tarjottavaa myös ihmiskunnalle. "Tarkat vertailun genomit ovat tärkeitä organismin biologian ymmärtämiselle, terveyden ja sairauksien geneettisten syiden oppimiseen ja eläimissä jalostukseen liittyvien päätösten tekemiseen", sanotaan National Human Genome Research Institute -lehden lehdistötiedotteessa.
Joskus eläimen perimän sekvensointi auttaa tutkijoita pysymään terävinä. Kanadalaiset tutkijat, jotka työskentelevät normaalisti ihmisgenomin parissa, sekvensoivat majavan perimän aiemmin tänä vuonna Kanadan 150. syntymäpäivän kunniaksi. "Suurin osa ponnisteluistamme kohdistuu ihmisgenomiin", tiedemies Stephen Scherer kertoi minulle. "Mutta se todella stimuloi meitä älyllisesti katsomaan enemmän kuin mitä teemme." Ei haittaa, että majava on Kanadan kansallinen symboli. Koska joskus hyvä suhdetoiminta on yhtä hyvä syy kuin mikään muu.
Papadum, San Clemente -vuohi, jonka perimä rekonstruoitiin uudella tekniikalla aiemmin tänä vuonna. (Brian L. Sayre)
