Ei ole epäilystäkään siitä, että mikroskooppiset vedessä elävät selkärangattomat, joita kutsutaan tardigradeiksi, sammaliporsaiksi tai vesikannoiksi, ovat omituisia. Kummallisesti ihastuttavat kriitikot voivat selviytyä avaruuden tyhjiöstä, kestää kuivuuden kuivumista ja esiintyä hengissä jäätymisen jälkeen muun muassa. Äskettäinen tutkimus viittaa siihen, että tardigrades ovat myös geenivarustajia - että niiden genomit pitävät enemmän DNA: ta toisistaan riippumattomista kasveista, bakteereista ja muista mikrobista kuin mikään muu eläin maapallolla, Rachel Nuwer raportoi äskettäin Smithsonian.com-sivustolle . Tämä kyky saattaa jopa selittää miksi tardigrades ovat niin joustavia, tutkijat ehdottavat.
Mutta noin viikko sen yllättävän löytön ilmoittamisen jälkeen toinen ryhmä on haastanut havainnot, raportoi Ed Yong The Atlanticille . Nopea edestakaisin kahden ryhmän välillä osoittaa, kuinka reagoiva ja mahdollisesti itsekorjautuva tiede voi olla digitaaliajalla.
Ensimmäisessä tutkimuksessa, joka tehtiin Pohjois-Carolinan yliopistossa työskentelevältä tiimiltä, kerrottiin, että yhdellä tardigrade-lajeilla on mahtava 6600 geeniä, jotka alun perin kuuluivat muiden valtakuntien organismeihin - lähinnä bakteereihin, mutta myös sieniin, kasveihin, viruksiin ja arhaeaan ja hankittiin prosessi, jota kutsutaan horisontaaliseksi geenisiirtoksi. Nämä havainnot tarkoittivat, että Hypsibius dujardinin genomi koostuu noin 17, 5 prosenttia vieraasta DNA: sta, tiimi raportoi Proceedings of the National Academy of Sciences -lehdessä . Koska jotkut vieraista geeneistä osallistuvat muiden organismien stressivasteisiin, tutkijat epäilevät, että he saattoivat antaa tardigradeille jonkin verran omia kykyjään sääolosuhteisiin.
Toinen ryhmä Edinburghin yliopistosta kuitenkin sekvensoi samat tardigrade-lajit ja sai hyvin erilaisia tuloksia. Niiden tutkijoiden mukaan kriittisellä on 36 - 500 vaakatasossa siirrettyä geeniä - paljon pienempi prosenttiosuus. Kun UNC: n paperi ilmestyi, Edinburghin tuloksia ei vielä julkaistu, mutta tutkijat sekoittivat julkaistakseen havaintonsa esipainatuspalvelimella bioRxiv.org - verkkosivustolla, jolla käsikirjoitukset voidaan julkaista ennen niiden lähettämistä päiväkirjaan ja vertaisarviointia. tieteellinen tutkimus.
Edinburghin ryhmä epäilee, että UNC-ryhmä on saattanut "sekvensoida DNA: ta bakteereista, jotka elivät tardigradejen rinnalla ja ovat parhaista ponnisteluistaan huolimatta erehtyneet näiden mikrobien geeneihin aitoihin tardigrade-geeneihin", kirjoittaa Yong. Mutta kuinka ensimmäinen ryhmä olisi voinut erehtyä, jos todella ovat? Yong selittää, että genomien sekvensointitekniikkaan sisältyy DNA: n pilkkominen pieniksi paloiksi ja sitten bittien kokoaminen uudelleen yhtenäiseksi kuvaksi. Jotkut kontaminaatiot voivat helposti lipsata sisään, joten tutkijat pyrkivät selvittämään, mitkä bitit kuuluvat tutkittavaan organismiin lähellä olevien mikrobien sijaan.
Edinburgh-ryhmä tajusi, että jotkut DNA-fragmentit olivat harvinaisia verrattuna muihin fragmentteihin. "Biologisesti ei ole mitään tapaa, nämä voivat olla osa samaa genomia", ryhmän johtaja Mark Blaxter kertoo Yongille. Ryhmä päätteli, että tardigraden genomissa on 500 geeniä, jotka olisivat voineet saada muista lähteistä, mutta heillä on vahvoja todisteita vain 36: sta niistä. Tämä antaa tardigradelle paljon tyypillisemmän osan vieraasta DNA: sta eläimelle.
UNC: n Thomas Boothby ja Bob Goldstein huomauttivat uusimmasta paperistaan, että he olivat tietoisia tästä mahdollisesta ongelmasta ja tekivät ahkerasti varmistaakseen, että se ei vaikuta heidän tuloksiinsa, mutta että virheitä on aina mahdollista. He lisäävät, että he tekevät lisätutkimuksia ennen kommentointia. Tutkijat kertoivat myös arvostavansa kilpailijoidensa päätöstä julkaista ristiriitaiset tuloksensa niin nopeasti verkkosivustossa bioRxiv.org .
Tunteet olivat molemminpuolisia. Sujai Kumar Edinburghin ryhmästä kertoi Yongille, että jos UNC-ryhmä ei olisi julkaissut tietojaan nopeasti, se olisi ollut heidän ryhmänsä kannalta haastavampaa. "Selvää on tieteen hämmästyttävä uusi kyky korjautua nopeasti", Blaxter kertoo Yongille. Se, mikä tässä tapauksessa kesti vain yhdeksän päivää, olisi kestänyt kuukausia aiemmin.
Toistaiseksi tuomaristo on edelleen selvittämättä, kuinka suuri osa tardigraden genomista tulee ulkomaisista lähteistä. Mutta vaikka nuo pienet olennot eivät olisi geenivarustajia, ne voivat olla otsikon varastajia jonkin aikaa.
Toimittajan huomautus: Tämän artikkelin on toimittanut Rachel Nuwer, joka alun perin kertoi Smithsonian.com-palvelun viivästystutkimuksesta.
